2014年1月26日，国家卫生计生委召开了全国人感染H7N9禽流感疫情防控工作视频会议。1月27日，中国疾控中心又组织召开了紧急视频会议，对《人感染H7N9禽流感疫情防控方案》进行了解读。会后，自治区疾控中心根据会议精神，对自治区人感染H7N9禽流感防控工作进行了紧急部署。

一是加强疫情监测，组织专家开展风险评估，及时研判疫情趋势。撰写了《自治区疾病预防控制中心关于近期人感染H7N9禽流感疫情风险评估意见》和《新疆维吾尔自治区突发公共卫生事件及重点关注的传染病风险评估月度报告》，上报自治区卫生厅。

二是下发了《自治区疾控中心关于做好2014年传染病和突发公共卫生事件应急处置工作的通知》（新疾控发[2014]4号），对2014年传染病和突发公共卫生事件应急处置工作进行安排；印发《自治区疾控中心关于加强2014年春节期间安全工作的通知》（新疾控发[2014]5号），安排应急人员值班，加强春节期间应急值班工作，落实到具体人员。

三是做好包括实验室检测试剂储备等应急物资储备工作，落实实验室检测人员值班制度，责任到人，强化实验室生物安全监管工作。

四是组织中心应急队员对国家卫生计生委发布的《人感染H7N9禽流感疫情防控方案》（第三版）及《人感染H7N9禽流感诊疗方案》（2014年版）进行学习培训。