2013年4月起，自治区疾控中心陆续收到了国家实验室认可、资质认定和食品检验机构资质认定证书。以上证书表明中心具备了按相应认可准则开展检测和校准服务的技术能力；获得签署互认协议方国家和地区认可机构的承认；并可参与国际间合格评定机构认可双边、多边的合作交流；可在认可的范围内使用CNAS国家实验室认可标志和ILAC国际互认联合标志并列入获准认可机构名录，提高了中心的知名度。中心将严格按照《检测和校准实验室能力认可准则》要求，恪守“严谨、诚信、高效”的服务理念，确保检测、检查结果“科学、准确、公正”,为疾病预防与控制、突发公共卫生事件预警与处置、检验检测与卫生学评价提供科学依据，为客户提供优质的检测和技术服务，为社会提供合法、公正、科学、准确的检测数据。

为获得实验室认可/资质认定/食品检验机构资质认定（简称“三合一”）证书，我中心自2012年3月起，开展了实验室“三合一”评审工作启动会、宣贯培训和实验室检测项目申请讨论会；聘请具有资质的北京爱格森信息咨询有限公司为我中心提供认可/认证的咨询服务；举办了实验室检验检测人员上岗培训班；督促所有认证科室按计划、分阶段开展认可工作；并于评审前进行了内部质量审核。

2012年9月21～22日，中国合格评定国家认可委员会（CNAS）及卫生部实验室专业评审组对我中心进行“三合一”现场评审工作。评审组通过查阅资料、现场参观、现场考核与评价、座谈会等方式对实验室认可准则要求的全部要素和技术能力进行了评审。通过评审，专家组一致认为中心的质量管理体系文件能涵盖CNAS-CL01、CL09、10、21全部要素以及《实验室资质认定评审准则》和《食品检验机构资质认定评审准则》的有关要求，质量管理体系运行基本正常有效；评审组对申请项目进一步拆分、合并，最后通过的检测项目达35类565项。中心对评审组现场评审发现的10个不符合项，及时整改，并将整改情况报评审组组长。评审组跟踪评审合格后，最终向CNAS推荐认可。